محصولات گروه مهندسی پروتئین رناپ
گروه مهندسی پروتئین رناپ از سال ۱۳۹۹ فعالیت خود را با توسعه انواع آنزیمهای مورد نیاز مجموعه رناپ آغاز کرد. آنزیمهای توسعه یافته توسط این گروه شامل آنزیمهای لازم برای تولید انواع RNA در مقیاس کوچک و صنعتی و همچنین آنزیمهای لازم برای فعالیتهای روزمره تحقیقات مولکولی و نیز آنزیمهای با موارد مصرف در کیتهای تشخیصی میباشد. از صفر تا صد توسعه و تولید این فراوردهها شامل طراحی سازه تا تولید، تخلیص، توسعه روشهای آنالیتیکال و پایش کیفیت توسط مجموعه رناپ انجام شده است. این گروه فعالانه در حال توسعه انواع جدیدی از پروتئینها و آنزیمها و کیتهای ترکیبی است که به مرور عناوین آنها به فهرست زیر افزوده خواهد شد.
کیت ها
کیت جادویی کلونینگ رناپ (Gibson Cloning) اولین کیت تخصصی مجموعه پروتئین نوترکیب به منظور پیشبرد اهداف کلونینگ با دقت فوقالعاده و کارایی حداکثری میباشد که به صورت مستمر در تمامی پروژههای فعال مربوط به کلونینگ در شرکت رناپ مورد استفاده قرار میگیرد. این کیت از ۳ آنزیم کلیدی تولید شده در شرکت رناپ ReNAP Phusion Polymerase، ReNAP T5 Exonuclease و ReNAP Taq DNA Ligase متشکل شده است تا پیشبرد فرآیند کلونینگ را با دقت رخداد ۱۰۰ درصدی تضمین کند. این فرآیند که در مدت زمان ۱۵ تا ۶۰ دقیقه و در دمای ۵۰ درجه سانتیگراد رخ میهد راهحلی مطمئن در پاسخ به انواع چالشهای کلونینگ میباشد.
کاربردها
- کلونینگ سریع با حداقل نیاز به آنزیمهای برشی
- امکان ایجاد تغییر در توالی با طراحی پرایمر مناسب
آنزیم ها
آنزیم Phusion، یک دنا بسپاراز (DNA Polymerase) high-fidelity با قابلیت تصحیح (Proofreading) میباشد که در فرآیندهای ampilification مورد استفاده قرار میگیرد. این آنزیم با دارا بودن یک دامین اتصالی به DNA و یک دامین اگزونوکلئازی دقتی تا ۵۰ برابر بیشتر از آنزیم Taq DNA Polymerase را ارائه میدهد و با توان بالای اتصالی به DNA آنزیم مناسبی برای تکثیر قطعات سخت تکثیر شونده میباشد.
کاربردها
- فرآیند Polymerase Chain Reaction (PCR)
- استفاده در Gibson Assembly Mix
آنزیم Taq DNA Polymerase از متداولترین بسپارازها (Polymerase) در فرآیندهای تکثیر قطعات DNA میباشد، این آنزیم از سویه گرمادوست Thermus aquaticus حاصل شده است و به علت هزینه و دسترسی مناسب به عنوان یک آنزیم کاربردی و متداول در انواع فرآیندهای تکثیر DNA مورد استفاده قرار میگیرد.
کاربردها
- فرآیند Polymerase Chain Reaction (PCR)
- مورد استفاده در انواع کیتهای تشخیصی
آنزیم T7 RNA Polymerase حاصل شده از باکتریوفاژ T7 از متداولترین بسپارازهای (Polymerase) RNA در مقیاس صنعت و آزمایشگاه میباشد، این آنزیم با شناخت توالی
۵’-TAATACGACTCACTATAG-3’ به عنوان پروموتر به صورت اختصاصی عمل میکند. آنزیم T7 RNA Polymerase به علت متداول بودن و اختصاصیت بالا به عنوان یکی از انتخابهای اصلی در فرآیندهای رونویسی درون آزمایشگاه مورد استفاده قرار میگیرد.
کاربردها
- فرآیند رونوشت آزمایشگاهی RNA (In-Vitro-Transcription)
آنزیم ReNAPScript IV یک وارونوشتاز مشتق از MMLV بوده که با اطمینان بالا در فرآیند رونویسی وارونه DNA از RNA مورد استفاده قرار میگیرد. آنزیم مهندسی شده ReNAPScript IV نسبت به آنزیم طبیعی در بخشهای عملکرد، پایداری در برابر بازدارندهها، مقاومت به گرما، رونویسی با کارایی بالا، فعالیت نوکلئازی و کینتیک آنزیمی بهبود یافته است و آن را به گزینه مناسبی برای استفاده در فرآیندهای دشوار تبدیل میکند.
کاربردها
- تولید و سنتز cDNA
آنزیم RNase R یک اگزوریبونوکلئاز ۳’ به ۵’ میباشد، این آنزیم توان تجزیه مولکولهای RNA تک رشته و دو رشته دارای انتهای آزاد در سمت ۳’ را دارا میباشد. به علت نیاز به انتهای آزاد، این آنزیم بر مولکولهای Circular RNA بیاثر بوده و کاربرد آن در خالصسازی این نوع از RNA میباشد.
کاربردها
- استفاده در فرآیند تولید و تخلیص Circular RNA
آنزیم BamHI یک آنزیم محدود کننده type II است که با شناخت توالی پالیندرومیک ۵′-GGATCC-3′ در DNA دو رشتهای توان ایجاد برش در گوانین سمت ۵′ را دارا میباشد. این آنزیم به صورت یک هومودایمر در سایز ۵۱ KDa عمل کرده و برای استفاده در فرآیندهای کلونینگ کاربرد دارد.
کاربردها
- فرآیندهای کلونینگ
- فرآیند Restriction Map Analysis
پروتئین ReNAP RNase Inhibitor یک پروتئین نوترکیب با قابلیت اتصالی بالا به اگزوریبونوکلئازهای پانکراتیک مانند RNase A میباشد.این پروتئین نوترکیب موشی به صورت ویژه در برابر فرآیند Oxidation مقاوم شده است و مقاومت بالاتری را نسبت به مهارکنندههای مشابه انسانی نشان میدهد.
کاربردها
- استفاده در فرآیند رونوشت آزمایشگاهی RNA (In-Vitro-Transcription)
- استفاده در فرآیند cDNA Synthesis
آنزیم نوترکیب Yeast Inorganic Pyrophosphatase یک آنزیم هیدرولاز میباشد که در تجزیه پیوند میان یک جفت پایروفسفات ایفای نقش میکند. این آنزیم با کاهش غلظت استوکیومتریک پایروفسفات در فرآیندهای آنزیمی همچون IVT به منظور افزایش کارایی، نقش به سزایی را ایفا میکند.
کاربردها
- استفاده در فرآیند رونوشت آزمایشگاهی RNA (In-Vitro-Transcription)